10月1日起，“三證合一”在全國范圍內實施，新設立企業(yè)、農民專業(yè)合作社領取由工商行政管理部門核發(fā)加載法人和其他組織統(tǒng)一社會信用代碼的營業(yè)執(zhí)照后，無需再次進行稅務登記，不再領取稅務登記證。
10月1日起，“三證合一”在全國范圍內實施，新設立企業(yè)、農民專業(yè)合作社領取由工商行政管理部門核發(fā)加載法人和其他組織統(tǒng)一社會信用代碼的營業(yè)執(zhí)照后，無需再次進行稅務登記，不再領取稅務登記證。但“三證合一”并不是簡單地“合”，以下三個方面的稅務風險不能忽視。
日常管理
“三證合一”后，無需辦理稅務登記，稅務登記信息與工商、質檢等部門的注冊登記信息比對分析也將不存在，但并不意味著稅務機關放棄或放松日常監(jiān)管，稅務機關將完善相關法規(guī)政策，加強后續(xù)管理。
《國家工商行政管理總局、國家稅務總局關于做好“三證合一”有關工作銜接的通知》（工商企注字〔2015〕147號）規(guī)定，企業(yè)登記機關新設登記、變更登記（備案）后，將其基本登記信息、變更登記（備案）信息即時共享到省級信息共享交換平臺。稅務機關確認納稅人信息后，將該稅務主管機關全稱即時共享到交換平臺。這樣，稅務與工商部門共享“一照一碼”注冊登記信息。
稅務機關對接收的新登記注冊戶應開展納稅身份甄別，確認負有納稅義務的，及時納入稅收管理。
發(fā)票管理
“三證合一”后，一些涉稅信息如稅種、票種登記等需要稅務機關補錄，才能納稅申報和購買發(fā)票，納稅人與稅務機關接觸最多的可能是申領發(fā)票，發(fā)票管理將取代稅務登記，成為整個稅收管理的基礎。
《國家稅務總局關于創(chuàng)新稅收服務管理若干問題的意見》（稅總發(fā)〔2014〕85號）規(guī)定，初次申領普通發(fā)票數(shù)量應控制在一個月用量或省稅務機關確定的初次領用數(shù)量范圍內。對納稅信用好、稅收風險低的納稅人可適當放寬，但最多不得超過省稅務機關確定的最高領用數(shù)量，省稅務機關未確定最高領用數(shù)量的，最多不得超過三個月使用量。對新開業(yè)的一般納稅人，稅務機關可按照納稅人生產經營規(guī)模、經營模式、行業(yè)特點、開具發(fā)票特殊性等因素設置增值稅專用發(fā)票基本月供應量，申領超過基本月供應量的納稅人，需向稅務機關提供相關證明材料。對小規(guī)模納稅人（包括個體工商戶）第一次申請發(fā)票增量時，可以要求其法定代表人或者財務負責人到場。對新增納稅人已領用發(fā)票卻未及時申報等情況，采取停止供應發(fā)票、實地核查等應對措施。對列入企業(yè)異常名錄的納稅人采取停供發(fā)票措施。同時，稅務機關對專用發(fā)票系統(tǒng)進行升級，而且推行電子發(fā)票，可以通過網絡實時監(jiān)控和掌握納稅人的發(fā)票開具信息。
“黑名單”管理
“三證合一”后，稅務機關應當分類處理納稅人清稅申報，根據(jù)企業(yè)經營規(guī)模、稅款征收方式、納稅信用等級指標進行風險分析，對風險等級低的當場辦結清稅手續(xù)；對于存在疑點情況的，企業(yè)也可以提供稅務中介服務機構出具的鑒證報告。稅務機關在核查、檢查過程中發(fā)現(xiàn)涉嫌偷、逃、騙、抗稅或虛開發(fā)票的，或者需要進行納稅調整等情形的，辦理時限自然中止。在清稅后，經舉報等線索發(fā)現(xiàn)少報、少繳稅款的，稅務機關將相關信息傳至登記機關，納入“黑名單”管理，將影響企業(yè)信用。
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